Marcus Onodera graduou-se em Direito pela Faculdade de Direito da Universidade de São Paulo, Largo de São Francisco, no final de 2001. Pouco depois, ingressou na magistratura em 2004, tornando-se Juiz de Direito do Tribunal de Justiça do Estado de São Paulo.
Ao longo de sua carreira, passou por diversas comarcas, como São José do Rio Preto, José Bonifácio e São Paulo. Em 2005, interessado pelo intercâmbio com outros países, iniciou seus estudos nos EUA, tornando-se Master in Comparative Law pela Samford University, Cumberland School of Law.
E, em 2008, a convite do Prof. Kazuo Watanabe, fez sua primeira viagem ao Japão, tendo, a partir daí, acentuado seu interesse pelo fortalecimento das relações entre Brasil e Japão. Após seu retorno, realizou doutorado também no Largo de São Francisco, sob orientação do Prof. Watanabe.
Em 2013, retornou ao Japão como bolsista do Gaimusho, ocasião em que consolidou seu apreço e admiração pela cultura e povo japonês. Em seu doutorado, foi Visiting Foreign Judicial Fellow pelo Federal Judicial Center, Washington. Lá estudou os sistemas legais norte-americano, alemão e japonês, para melhoria do sistema legal brasileiro. Sua tese, posteriormente, tornou-se disciplina de pós-graduação na USP, sob coordenação dos Profs. Watanabe e Antonio Carlos Marcato.
Posteriormente, foi convocado junto à Assessoria do Tribunal de Justiça e CNJ e, atualmente, é Juiz Auxiliar do Supremo Tribunal Federal, junto ao Ministro Nunes Marques.